Ces carences peuvent induire à plus ou moins long terme des troubles de santé non négligeables tels que des répercussions sur l’ensemble de la production hormonale induisant notamment une réduction de la production des hormones sexuelles qui peut souvent conduire à un arrêt des cycles chez la femme ou à un hypogonadisme chez l’homme (baisse de la testostérone).
Ces changements hormonaux et la diminution de substrat (briques) pour former les protéines affectent rapidement l’ensemble de l’organisme.  On retrouve ainsi une perte osseuse conduisant à une ostéoporose et à des fractures comme complications.
Une diminution de la masse musculaire et donc de la force entraine de la faiblesse et des chutes.
Certaines études démontrent aussi des atteintes du cartilage. La peau, les poils, les ongles et les cheveux sont aussi sensibles de même que l’ensemble des organes.